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DNA亲子鉴定中心之序列质量的问题

2017-03-24 15:10 作者: 来源: 本站 浏览: 我要评论 字号:

摘要: 在几本近期的出版物上PeterForster 和Hans Bandelt提出了mtDNA数据库质量及其对精确估计随机匹配率影响的讨论。利用系统发育学这一统计分析工具,系统比较了多个DNA序列和近亲的DNA序列之间的相似和差异。建立和比较序列排列来寻找差异极大...

在几本近期的出版物上PeterForster 和Hans Bandelt提出了mtDNA数据库质量及其对精确估计随机匹配率影响的讨论。利用系统发育学这一统计分析工具,系统比较了多个DNA序列和近亲的DNA序列之间的相似和差异。建立和比较序列排列来寻找差异极大的样本。极度或不寻常的差异可能提示:样本污染或序列数据没有正确录入。例如,实验室可能把一个样本HV2的序列当作这个样本HV1的数据,因此引起了人为重组或偶然复合序列 。这样,系统发育学分析能够核实序列质量中发挥作用。

线粒体DNA人群数据库的错误可以分成四种类型:1 结果誉写错误;2 样本混合;3 污染;4 使用不同的命名。

从21个实验室先期的联合研究中发现,在150个提交的样本/单倍型中(其中包括了约150000个碱基)观察到14种不一致的单倍型(16个个体错误)。当从原始序列数据到最后报道的信息转移时,采用完整的电子版转移数据和碱基命名的措施以避免笔误。将来,mtDNA数据库可能要求保留群体样本的原始数据,能更容易地核实结果的真实性,以便日后方便查阅。

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